iCloudの同一アカウントが複数表示されてしまうことがある。そうなるとメモも同じものが複数表示されるし、Notesを共有しないようにアカウントを設定しても、一つは残る。
そんなときには、On My MacなノートをすべてiCloud上に移して、同期が終わったら、NotesとMailを終了して
cd ~Library/Data; rm -rf com.apple.Notes
としてデータをすべて削除してから再起動。これでNotesを初期化できる。
Notesはエクスポートとインポートのメニュー項目を持っていないので、バックアップはiCloudか他のインターネットサービスに作成するのがお勧め。あと、消えて困るデータがOn My Macに残っている状態で上のコマンドを実行するのは、お勧めできない。